趨磁真菌研究進(jìn)展_真菌果膠酶的研究進(jìn)展
發(fā)布時(shí)間:2020-02-16 來源: 歷史回眸 點(diǎn)擊:
收稿日期:2006-09-22? 作者簡介:黃娟(1981-),女,湖南益陽人,武漢科技大學(xué)中南分校生命科學(xué)學(xué)院教師。? 。ㄎ錆h科技大學(xué)中南分校 生命科學(xué)院,湖北 武漢 430223)?
摘要:果膠酶作為植物病原真菌的重要致病因素之一,近年來研究進(jìn)展較為迅速。本文闡述了果膠酶的分類、結(jié)構(gòu)、功能、表達(dá)、以及基因調(diào)控,同時(shí)對果膠酶在植物病程中的作用也進(jìn)行了介紹。?
關(guān)鍵詞:果膠酶;表達(dá);基因調(diào)控?
中圖分類號:Q55 文獻(xiàn)標(biāo)識碼:A??
自1966年Bateman和Millar研究了果膠酶在植物細(xì)胞壁降解中的作用[3,4],迄今對果膠酶在各方面的研究進(jìn)展十分迅速[4]。許多學(xué)者利用層析,電泳,放射免疫化學(xué)等現(xiàn)代科技手段對果膠酶的生物化學(xué)進(jìn)行了廣泛的研究,明確了一些病原菌果膠酶的氨基酸組成,分子量,同工酶數(shù)量及酶動力學(xué)[1,2,3,5],在遺傳學(xué)方面,某些果膠酶的編碼基因已得到克隆,通過質(zhì)粒建立了相應(yīng)的克隆基因庫,研究了某些果膠酶編碼基因的同源性[4]。在植物病理學(xué)方面,為了探索果膠酶在植物病程中的作用,從生理及超微結(jié)構(gòu)上研究了罹病組織內(nèi)果膠酶的活性;許多學(xué)者探討了在寄主和寄生物自然變異條件下罹病組織內(nèi)病菌致病性和果膠酶活性之間的相互關(guān)系,利用果膠酶進(jìn)行了病害癥狀復(fù)制,并對果膠酶缺陷型突變株致病性表現(xiàn)型進(jìn)行了系統(tǒng)的觀察、分析,初步證實(shí)了高度純化的果膠酶可以浸解植物細(xì)胞壁,病原菌果膠酶的產(chǎn)生及調(diào)控與植物發(fā)病并非是簡單的相互關(guān)系。?
一、果膠酶的分類及酶的動力學(xué)研究?
。ㄒ唬┕z酶的種類?
根據(jù)酶所催化的反應(yīng)類型,果膠酶分為水解酶和轉(zhuǎn)消裂解酶兩大類。果膠水解酶類已知有6種,如內(nèi)聚半乳糖醛酸酶(endo-PG),果膠甲酯酶(PME或PE);轉(zhuǎn)消裂解酶類已知有4種,如內(nèi)果膠甲基轉(zhuǎn)消酶(endoPMTE)或果膠裂解酶(PNL)、內(nèi)聚半乳糖醛酸轉(zhuǎn)消酶(endoPGTE)或果膠酸裂解酶(PL)。果膠酶一般都有兩種形式endo-和exo-,endo-的形式比exo-的形式更有效,因?yàn)閑ndo-形式的酶可以以隨機(jī)方式作用于底物的a-1,4糖苷鍵的任何部位,生成各種寡聚體的混合物,而exo-形式的酶僅作用于非還原性末端糖苷鍵,生成定量的二聚體,所以在罹病植物中endo-形式的果膠酶多于exo-形式。?
1.多聚半乳糖醛酸酶(PG)?
曲霉菌PG最初(1990)從商品的黑曲霉(A.niger)果膠酶分離到5種endoPG 1種exoPG。主要的endoPG為endoPGⅠ和endoPGⅡ,分子量分別為55kDa和38kDa,兩者的等電點(diǎn)、比活、對寡聚底物的作用方式及氨基酸組成全然不同。另外3種endoPG即endoPGⅢA,endoPGⅢB和endoPGⅢC的生理活性與endoPGⅠ極相似。其后從黑曲霉基因組文庫分離出幾個(gè)基因,編碼的endoPGE分子量35.6kDa,pI=3.6,最適pH=3.8。endoPGE與endoPGC的AA序列同源性最高,有77.6%相同,與endoPGⅠ和endoPGⅡ的同源性較差,分別為57.6%和54.3%相同[6]。米曲霉(A.oryzae)有2種PG,分子量分別為41kDa和39kDa,最適pH為5.0,最適溫度分別為45℃和55℃[7]。黃曲霉(A.flavus)兩個(gè)PG基因即pecA和pecB,前體蛋白預(yù)期分子量分別為37.6kDa和38kDa[8]。其它曲霉菌,如 A.ustus的endoPG分子量為36kDa,pI=8.3。A.parasiticus的endoPG基因pecA用黑曲霉pgaⅡ做探針分離到,與其它真菌的PG基因極相似。A.tubigensis的endoPG基因pgaⅡ與 A.niger的pgaⅡ基因的核苷酸序列有83%相同,前體蛋白AA序列94%相同。?
灰霉菌(Botrytiscinerea)PG最初從在蘋果果膠上培養(yǎng)的灰霉菌分離得到5種PG同工酶(Ⅰ―Ⅴ),4個(gè)酸性,1個(gè)堿性,pI分別為9.3、4.9、4.6、3.7、2.7,其中以PGⅢ比活最高,PGⅠ為內(nèi)切酶,另4種為外切酶。后來從灰霉菌引起的蘋果腐敗組織中分離到1種exoPG,表觀分子量為45kDa,pI=4.6,與此菌在液培時(shí)產(chǎn)生的同工酶的pI、最適pH和作用方式相似。另用A.niger的pgaⅡ基因做探針從灰霉菌分離到6個(gè)endoPG的編碼基因,這6個(gè)基因編碼的endoPG前體的氨基酸序列有34―73%相同,可分到3個(gè)單源(monophyletic)組中[9]。?
鐮孢菌(Fusariumspp.)的PG番茄尖鐮孢(Fusariumoxysporumf.sp.lycopersici)一種主要胞外endoPG前體蛋白分子量41.1kDa,成熟蛋白推算分子量為35.5kDa,pI=6.2,與F.moniliforme的PG,C.carbonum的PGN1,A.niger的PG,A.oryzae的PG,和S.sclerotiorum的PG1分別有82.9%、29%、27.6%、14.2%和26.9%同源性[10]。?
番茄根腐尖鐮孢(F.oxysporumf.sp.radicis.lyc-opersici)在降解果膠時(shí)先產(chǎn)生endoPG,以后以exoPG為主。exoPG與其它真菌的endoPG相似程度高[11]。串珠鐮孢(F.moniliforme)也有一種endoPG。?
其它真菌的PG菜豆炭疽病菌(Clletotrichumlindermuthianum)已有2個(gè)endoPG基因被克隆,其中pg1編碼主要的endoPG,這個(gè)基因在病菌腐生時(shí)和在侵染植物時(shí)都表達(dá)。在菜豆壞死組織中檢測到,與細(xì)胞壁大量降解有關(guān),RT-PCR表明在侵染的死體營養(yǎng)階段開始時(shí)pg1表達(dá)。pg2與pg1AA序列有61%相同,與其它真菌的endoPG有37%-59%相同[12]。?
核盤菌(Sclerotinia sclertiorum)的endoPG有多種等電點(diǎn)不同的同工酶,其中pg1是一種中性蛋白,endoPG2和endoPG3的等電點(diǎn)分別為4.8和4.9,分子量相似,氨基酸組成上僅在天冬氨酸,天冬酰胺組成上不同,與PG1氨基酸序列分別有90%和89%相同。用PG3制備的抗體與PG2有交互反應(yīng),但不與黑曲霉PG反應(yīng)。endoPG由多基因家族編碼,7個(gè)基因構(gòu)成這個(gè)家族的2個(gè)亞家族。比較這個(gè)基因家族的3個(gè)成員的編碼區(qū)的核苷酸序列,發(fā)現(xiàn)差異很小[13]。北方核盤菌(S.borealis)有1種特殊的喜冷endoPG,分子量為40kDa,等電點(diǎn)為7.5,最適pH為4.5,適溫為40―50℃,在5℃仍有30%的活性,60℃時(shí)活性弱[14]。?
玉米圓斑病菌(Coboluscarbonum)的1個(gè)endoPG基因pgn1和1個(gè)exoPG基因pgx1已分離到,pgx1產(chǎn)物PGX1前體推算分子量為48kDa,與A.tubingensis的exoPG有61%氨基酸相同。Pgx1突變菌系在果膠上生長慢,對玉米仍致病,pgn1/pgx1雙突變菌系盡管PG活性只及野生型1%,但仍對玉米致病[15]。青霉菌P.oxalicum有2種PG,PGⅠ不太穩(wěn)定,為外切酶,PGⅡ?yàn)閮?nèi)切酶,活性強(qiáng),4小時(shí)內(nèi)可浸解和殺死木薯組織,在病程中似起主要作用。P.janthnillum和P.griseoroseum各有1種PG[16]。啤酒酵母(Scchato mycescerevisiae)CECT1389菌系一種endoPG表觀分子量39kDa,最適pH為5.5,最適溫度為45℃。啤酒酵母PG與其它真菌的PG有54%同源。與植物和細(xì)菌的PG只有24%同源。每個(gè)單倍體只有1個(gè)單基因拷貝[17]。?
脈孢菌(Neurosporacrassa)的endoPG洗脫成單一活性峰,提純的PG為單體糖蛋白(38%CH2O),表觀分子量36.6~37.0kDa,最適pH6.0,最適溫度45℃[18]。栗疫菌(Cryphonectri aparasitica)的成熟蛋白ENPG-1推定分子量為34.5kDa,pI=7.2,與玉米圓斑病菌的endoPG有66%相同[19]。榆枯萎病菌(Ophiostromanovoulmi)也有一種PG。?
2.果膠裂解酶(PL)?
果膠裂解酶(PL)主要是曲霉菌和鐮孢菌產(chǎn)生PL,此外還有P.oxalicum和啤酒酵母和灰霉菌。從黑曲霉已克隆到6個(gè)PL編碼基因,即pelA、pelB、pelC、pelD、pelE和pelF,其中pelA和pelD分別編碼商品果膠酶Ultram的兩種主要PL即PLⅠ和PLⅡ。從茄鐮孢豌豆;停‵.solanif.sp.pisi)分離到4個(gè)endoPL基因,即pelA、pelB、pelC、pelD[20]。pelA編碼的endoPLA前體蛋白29kDa,成熟蛋白26kDa,pI=8.3,最適pH=9.4。pelB編碼的PLB分子量為25.6kDa,最適pH值10.0。與PLA的AA序列有65%相同,PLA和PLB與其它果膠酶無明顯的同源性。PecC編碼的PLC分子量23.3kDa,與PLA有血清關(guān)系,AA序列與有51%相同,最適pH9.5,活溫55℃。pelD編碼的PLD分子量24.5kDa,成熟蛋白分子量22.7kDa,AA序列與PLA、PLB、PLC分別有49%、44%、65%相同。?
番茄尖鐮孢編碼PL1的基因與茄鐮孢豌豆;停‵.solanif.sp.pisi)的pelA、pelB、pelC、pelD基因分別有89%、67%、55%和56%同[21]。?
3.果膠酯酶(PE)?
黑曲霉、啤酒酵母和玉米圓斑病菌等菌具有PE,PE去酯化是隨機(jī)的。?
。ǘ┕z酶動力學(xué)的研究?
酶動力學(xué)的研究目前集中于endoPG,PME(PE)及其同工酶方面,不同種病菌分離自同一種果膠酶在分子量,最適pH值,pI,氨基酸組成,Km等方面均有所差異,即使從同一種病菌分離的同一種果膠酶,也因?qū)嶒?yàn)條件的不同而不完全一致。一般而言,除PME外,其它果膠水解酶的最適pH值均在4.0―5.0之間,pI偏低,在6.0―8.0之間,而轉(zhuǎn)消裂解酶最適pH值在9.0―9.5之間,pI在8.0―9.0之間,并且容易被二價(jià)陽離子激活[5,22]。果膠酶的最適pH值比較穩(wěn)定,這是分離提純兩大類果膠酶的依據(jù)之一。一般果膠酶的最適溫度均在40―53℃。細(xì)菌果膠酶復(fù)合體中,PL有各種同工酶,pI分別為堿性,酸性,中性[23];真菌果膠酶復(fù)合體中,水解酶有同工酶,如從Botrytis cinerea等真菌分離到的endoPGI,Ⅱ[5、22]。PLb和PLc,PEI和PEⅡ和酶學(xué)特性相似,可能是由重復(fù)基因編碼所致。Botrytiscinerea的PG和PE符合米氏方程,谷氨酸為PG的競爭性抑制因子。Km和Vmax受鹽濃度影響。?
二、真菌果膠酶的結(jié)構(gòu)與功能?
真菌果膠酶基因的開放讀碼框(ORF)絕大多數(shù)被內(nèi)含子分隔。內(nèi)含子最多的達(dá)7個(gè),兩種已克隆的PE基因都有6個(gè)內(nèi)含子。?
果膠酶的前體蛋白N信號肽一般為16~27AA,個(gè)別如曲霉菌的PGC有一個(gè)較長的N信號肽(40AA),有的PL無N信號肽。?
許多果膠酶都有糖基化位點(diǎn),如串珠鐮孢endoPG前體有4個(gè)糖基化位點(diǎn)。關(guān)于酶的活性中心,對24種曲霉PG的分析表明,一個(gè)外露的Tyr殘基在pH9.3~9.5時(shí)離子化,可能與催化有關(guān),內(nèi)藏的Tyr殘基與催化關(guān)系密切,在pH10.5時(shí)離子化[24]。串珠鐮孢endoPG的His234對酶活性和浸解活性起關(guān)鍵作用,與結(jié)合PG1P無關(guān),當(dāng)His234→Lys時(shí)無酶活,Ser237和Ser240→Gly時(shí),酶活性分別降低48%和6%。?
三、表達(dá)與調(diào)控?
如前所述,多種真菌的果膠酶已在酵母菌中正確表達(dá)。如茄鐮孢豌豆;蚿elB、pelC、和pelD的cDNA轉(zhuǎn)入一種畢氏酵母(Pichiapastoris)可表達(dá)。果膠酶一般受果膠、植物維管組織、低濃度的(0.1%)D半乳糖醛酸、半乳糖誘導(dǎo),受葡萄糖、較高濃度(1%)的半乳糖醛酸、抗體、某些抗菌素(如阿莫西林)、植物的PG抑制蛋白(PGIP)抑制。Ca2+抑制一些PG,而一些PL的活性需Ca2+參與個(gè)別果膠酶基因組成型表達(dá)。?
四、真菌果膠分解酶的加工和輸出?
真菌果膠酶一般有糖基化位點(diǎn),功能酶以糖蛋白形式存在。如玉米圓斑病菌pgx1N端有12AA的糖基化位點(diǎn),糖蛋白分子量60kDa,去糖基后表觀分子量45kDa[15]。核盤菌在多聚半乳糖醛酸的培養(yǎng)基上培養(yǎng)的早期分泌的2種endoPG都是糖蛋白。番茄根腐尖鐮孢exoPG的糖基化程度高,糖蛋白形式存在時(shí)分子量為66kDa,去糖后50kDa[11]。不過以黑曲霉的endoPC糖基化程度最高。?
果膠酶一般輸出到胞外,如啤酒酵母的endoPG。?
五、果膠酶在植物病程中的作用?
果膠酶在植物中的作用是復(fù)雜的,它雖然可以由許多微生物產(chǎn)生。然而,一些微生物即使能在離體條件下產(chǎn)生,但在自然條件下的植物體內(nèi)卻不一定產(chǎn)生。因此能產(chǎn)生果膠酶的微生物不一定就是病原物。要確定在自然生態(tài)條件下果膠酶的作用,必須了解果膠酶產(chǎn)生系統(tǒng)內(nèi)的選擇壓力,而實(shí)現(xiàn)這一目標(biāo)的重要手段就是在其它的寄主和環(huán)境下,探索產(chǎn)生果膠酶的突變株的各種表現(xiàn)型。?
在有些病害中,果膠酶的活性與致病性呈正相關(guān),但也有不少事實(shí)證明果膠酶的活性與致病性無關(guān),所以有人提出果膠酶可能是在病程中,病害復(fù)合體的諸因素之一,也就是說病菌的致病性可能還有其它必要的基因控制,也有人認(rèn)為果膠代謝在植物病程中不是必須的,果膠酶的誘導(dǎo)產(chǎn)生只是對植物內(nèi)部效應(yīng)因子的反應(yīng)?傊,對于果膠代謝在植物病程中的作用有待進(jìn)一步探索。有些病菌(尤其是真菌)盡管在不同的植物細(xì)胞壁上生長速度不同,但這種生長速度的差異與果膠酶的產(chǎn)生或寄主一寄生物相互親合性無關(guān)。因而每種病菌與寄主的關(guān)系不能簡單化和通用化。?
六、結(jié) 語?
真菌果膠酶的多樣性使我們在利用果膠酶時(shí)有了更大的選擇余地。對于一些產(chǎn)果膠酶也產(chǎn)致癌毒素如黃曲霉素的真菌,可將其果膠酶基因轉(zhuǎn)入不產(chǎn)毒素的真菌如酵母菌和米曲霉中。為得到單一的果膠酶,可將其基因克隆到不產(chǎn)果膠酶的相近真菌中。用強(qiáng)啟動子如TEF1α啟動子取代果膠酶基因原有的啟動子或在果膠酶的發(fā)酵生產(chǎn)中加入果膠酶誘導(dǎo)物可用以提高產(chǎn)量,而在果實(shí)貯藏期間可用果膠酶抑制物處理或轉(zhuǎn)PGIP基因入植物可防軟化。富含果膠的物質(zhì)如蘋果渣既是果膠酶誘導(dǎo)物和底物,也是果膠酶的良好載體。北方核盤菌喜冷endoPG的發(fā)現(xiàn)為果膠物質(zhì)的低溫降解提供了可能。在許多重要植物病害中,果膠酶是重要的致病因素之一。真菌果膠酶的進(jìn)一步研究將有助于更合理地利用果膠酶。?
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