摘 要 為建立一種快速檢測蝦肝腸胞蟲（EHP）的環(huán)介導等溫擴增方法（LAMP），根據GenBank中登錄的EHP-SSU基因序列設計了6條LAMP特異性引物，經反應體系和反應條件的優(yōu)化，建立了EHP-LAMP檢測方法。該方法的檢出限為3.71個質�？截�/μL；與對蝦其他常見病毒病的病原（WSSV、IHHNV、CMNV）均無交叉反應。使用LAMP方法和普通PCR方法對30份具有典型EHP感染癥狀的對蝦樣品進行檢測，結果顯示：LAMP和PCR方法的陽性檢出率均為100%。表明建立的EHP-LAMP方法具有高靈敏度、高特異性、高準確度的優(yōu)點，適用于生產中對蝦肝腸胞蟲的快速早期診斷，為EHP的防治提供技術支撐。
　　關鍵詞 對蝦；肝腸胞蟲；環(huán)介導等溫擴增；檢測
　　中圖分類號：S945.4 文獻標志碼：B DOI：10.19415/j.cnki.1673-890x.2018.09.058
　　1 材料與方法
　　1.1 試驗材料和儀器設備
　　采自天津市東麗區(qū)華明街胡張莊村的南美白對蝦樣品，具有典型的EHP感染癥狀，經PCR檢測并測序后確認為EHP感染，由本實驗室保存；經檢測未感染EHP的對蝦基因組、僅感染對蝦白斑病毒（WSSV）的對蝦基因組、僅感染對蝦皮下及造血組織壞死病毒（IHHNV）的對蝦基因組、僅感染偷死野田村病毒（CMNV）的對蝦RNA均由本單位病原檢測室提供；海洋動物組織基因組DNA提取試劑盒（天根生物）；10 mM dNTP、質粒提取試劑盒均購自大連寶生物（TakaRa）；Bst DNA聚合酶（NEB）、鈣黃綠素染料（北京藍譜）、甜菜堿（Sigma）。PCR儀（ABI）、凝膠成像系統(tǒng)（Biometra）、金屬浴（天根生物）、離心機（Sigma）、電泳儀（北京六一）[1]。
　　1.2 方法
　　1.2.1 LAMP引物設計與合成
　　根據GenBank發(fā)布的EHP基因序列及相關文獻資料，選取EHP-SSU（登錄號：FJ496356.1）為靶基因，按照LAMP引物設計原則，使用在線設計軟件Primer Explorer version 5 （http：//primerexplorer.jp/e）設計6條引物，分別為外引物F3/B3，內引物FIP/BIP和環(huán)引物LF/LB，引物由上海生工合成[2]。
　　1.2.2 LAMP反應條件優(yōu)化
　　按照海洋動物組織基因組DNA提取試劑盒說明書提取感染EHP對蝦的基因組DNA，作為LAMP擴增反應的模板。EHP-LAMP的基礎反應體系（25μL）：2.5μL 10×Bst DNA聚合酶buffer，3.5μL 10 mM dNTP，1.5μL 100 mM MgSO4，0.4μL 100 μM FIP，0.4 μL 100 μM BIP，0.2μL 100 μM LF，0.2μL 100μM LB，0.05μL 100 μM F3，0.05μL 100μM B3，8 U Bst DNA聚合酶，1μL鈣黃綠素染料，3μL 5 M甜菜堿，滅菌水適量，2μL模板�；�礎反應條件為63 ℃ 60 min，80 ℃ 10 min。為了得到最佳擴增效果，在基礎反應體系上對其可能影響較大的試劑，如甜菜堿、dNTP、MgSO4、Bst DNA聚合酶等的用量以及反應條件進行優(yōu)化。
　　1.2.3 LAMP反應體系的靈敏度試驗
　　將用于EHP-LAMP引物設計的SSU基因序列與pUC57載體連接，構建SSU-pUC57質粒，質粒構建工作由上海生工完成。利用質粒提取試劑盒提取SSU-pUC57質粒，利用核酸檢測儀測定所提取質粒的初始濃度，根據公式：質粒拷貝數(shù)/μL=質粒濃度（g/μL）/質粒分子量×阿佛加德羅常數(shù)，計算出SSU-pUC57質粒拷貝數(shù)為3.71×109，用滅菌水按10倍遞進稀釋法將質粒稀釋至3.71個質粒拷貝/μL，取2μL各濃度稀釋液分別進行LAMP和PCR擴增（以F3/B3為上下游引物進行PCR擴增，產物大小為191 bp），比較兩種方法的最低檢測量。
　　1.2.4 LAMP反應體系的特異性試驗
　　將天津市水生動物疫病預防控制中心病原檢測室提供的僅感染WSSV的對蝦基因組、僅感染IHHNV的對蝦基因組、僅感染CMNV的對蝦RNA（反轉錄成cDNA后作為模板）以及感染EHP的對蝦基因組，同時設陰性對照和陽性對照（SSU-pUC57質粒），按照上述建立的LAMP方法進行EHP-LAMP檢測體系的特異性分析。
　　1.2.5 臨床樣品的檢測
　　同時利用本研究建立的EHP-LAMP檢測技術和PCR方法，分別對挑選30尾具有典型感染EHP癥狀的對蝦進行檢測，并將這兩種方法得到的結果進行比較。
　　2 結果
　　2.1 EHP-LAMP的優(yōu)化結果
　　經試驗結果綜合分析，發(fā)現(xiàn)甜菜堿、MgSO4和dNTP的加入量對EHP-LAMP反應體系的擴增效率影響較大。最終確定EHP-LAMP的最佳反應體系為：2.5 μL 10×Bst DNA聚合酶buffer，2.5 μL 10 mM dNTP，2 μL 100 mM MgSO4，0.4 μL 100 μM FIP，0.4 μL 100 μM BIP，
　　0.2 μL 100 μM LF，0.2 μL 100 μM LB，0.05 μL 100μM F3，0.05 μL 100μM B3，8 U Bst DNA聚合酶，1 μL鈣黃綠素染料，1 μL 5M甜菜堿，2 μL模板滅菌水定容總體積至25 μL。反應條件為63 ℃ 40 min，80 ℃ 5 min。
　　2.2 靈敏度試驗結果
　　利用優(yōu)化條件后的EHP-LAMP和PCR檢測方法對不同稀釋倍數(shù)的模板進行擴增，結果顯示：LAMP檢測方法的檢出限為3.71個質�？截�/μL，PCR檢測方法的檢出限為371個質�？截�/μL，LAMP檢測方法的靈敏度高于PCR。

相關熱詞搜索：肝腸 檢測方法 建立 LAMP